PhD optimalisatie van bloedplasmabereiding voor EV-gebaseerde kankerdiagnostiek

Bij de keuze voor een kankerbehandeling is vaak niet bekend of een individuele patiënt op een bepaalde behandeling zal reageren. Om dit vraagstuk aan te pakken, zijn we gestart met Secret-omics: een multidisciplinair onderzoeksproject waarin vijf Nederlandse onderzoeksinstituten en 21 internationale bedrijven samenwerken. Binnen Secret-omics ontwikkelen we nieuwe bloedtesten die extracellulaire vesikels (EV's) analyseren die door tumoren worden afgegeven. Deze tumor EV's bevatten informatie, het zogenaamde secretome, die gerelateerd is aan de respons op behandeling.

Een belangrijke uitdaging binnen biomarker onderzoek naar EV's is de wisselende samenstelling van verzameld bloed en bloedplasma dat in biobanken wordt opgeslagen. Huidige protocollen voor bloedafname, verwerking en opslag kunnen leiden tot wisselende concentraties van andere deeltjes dan EV's. Deze deeltjes kunnen de signalen van daaropvolgende analyses beïnvloeden en daarmee leiden tot onbetrouwbare biomarker metingen.

In dit promotietraject richt je je op het optimaliseren van de bereiding en opslag van bloedplasma, waarbij je het volledige EV-secretome behoudt. Je ontwikkelt gestandaardiseerde methoden om de samenstelling van plasma te beoordelen en kwaliteitsparameters voor biobanken vast te stellen.

Samen met clinici, biomedische onderzoekers en industriële partners valideer je deze methoden in klinische biobanken. Ook ontwikkel je goed gedefinieerde testsamples die de technologische ontwikkeling binnen het hele Secret-omics-consortium ondersteunen. Met jouw onderzoek leg je de basis voor robuuste en reproduceerbare EV-gebaseerde diagnostiek voor de selectie van kankerbehandelingen.

Wil je alvast meer weten over de verschillende fases binnen het PhD-traject? Op deze pagina lees je hierover meer informatie.

Als promovendus binnen het Secret-omics-project speel je een centrale rol bij het ontwikkelen en valideren van methoden om de bereiding van bloedplasma voor EV-analyse te optimaliseren. Je werkt op het snijvlak van klinische chemie, bio-engineering en biomarkeronderzoek. Met jouw onderzoek draag je bij aan de ontwikkeling van betrouwbare EV-gebaseerde biomarkers voor de selectie van kankerbehandelingen.

Je gaat:

• methoden ontwikkelen om de kwaliteit van bloedplasma te beoordelen, waaronder de aanwezigheid van resterende bloedcellen en hemolyse;
• onderzoeken hoe bloedafnamebuizen en pre-analytische variabelen de samenstelling van plasma en het EV-secretome beïnvloeden;
• experimentele protocollen ontwerpen en optimaliseren voor de bereiding en opslag van bloedplasma, waarbij het EV-secretome behouden blijft;
• de kwaliteit van monsters uit klinische biobanken beoordelen en inclusie- en exclusiecriteria vaststellen voor daaropvolgende biomarkeranalyses;
• gestandaardiseerde testsamples ontwikkelen en valideren voor technologische ontwikkeling binnen het consortium.

Daarnaast pas je analysetechnieken toe, zoals flowcytometrie en spectrofotometrische assays. Samen met academische en industriële partners integreer je jouw onderzoek binnen het bredere Secret-omics-project.

Deze functie biedt je de mogelijkheid om sterke experimentele, analytische en conceptuele vaardigheden te ontwikkelen en tegelijkertijd bij te dragen aan klinisch relevante innovaties op het gebied van kankerdiagnostiek.

We zoeken een enthousiaste, gemotiveerde en nieuwsgierige kandidaat die wil bijdragen aan innovatief biomarker onderzoek. Je werkt graag in een multidisciplinaire omgeving en vindt het interessant om experimentele inzichten te vertalen naar robuuste en reproduceerbare methoden.

Je hebt ook:

• een masterdiploma in biomedische wetenschappen, (bio)medische laboratoriumwetenschappen, moleculaire of cellulaire biologie of een vergelijkbare opleiding;
• een sterke interesse in biomarkeronderzoek, klinische chemie en/of de biologie van extracellulaire vesikels;
• affiniteit met experimenteel laboratoriumonderzoek en bij voorkeur ervaring met technieken zoals celkweek, flowcytometrie of biochemische assays;
• interesse in methodeontwikkeling, standaardisatie en pre-analytische processen, gecombineerd met sterke analytische en organisatorische vaardigheden;
• een proactieve en samenwerkingsgerichte houding, goede communicatieve vaardigheden en een uitstekende beheersing van het gesproken en geschreven Engels.

Programmeervaardigheden zijn een pré. Je neemt verantwoordelijkheid voor je eigen werk en bent flexibel wanneer dat nodig is.