Postdoc in cardiovasculaire beeldanalyse

De afdeling Biomedical engineering & physics van Amsterdam UMC zoekt een postdoc met ervaring in medische beeldvorming, deep learning en het modelleren cardiovasculaire systemen.

In dit project werk je aan het verbeteren van risicostratificatie voor mensen met het Marfan-syndroom, ter ondersteuning van de chirurgische besluitvorming. Het onderzoek combineert cardiovasculaire beeldanalyse (vooral 4D flow MRI), deep learning en computationele biomechanica, en richt zich op het opsporen van geometrische en mechanische kenmerken van de aorta bij Marfan-patiënten.

Je ontwikkelt en optimaliseert AI-tools voor het automatisch segmenteren van de aorta, en het uitvoeren van geometrische analyses en simulaties. Je houdt je bezig met het bouwen en testen van deze machine learning-pipelines en vertaalt de modeluitkomsten naar de klinische context. Deze functie biedt een mooie kans om een bijdrage te leveren aan grensverleggend cardiovasculair onderzoek op het snijvlak van technologie, geneeskunde en data science.

Als postdoc:

• pas je AI en deep learning toe en ontwikkel je deze verder voor cardiovasculaire beeldanalyse (CT/MRI), waarbij de focus ligt op de aorta bij Marfan-patiënten;
• bouw je deep learning-modellen voor 3D segmentatie, beeldregistratie en het verwerken van graphs en surface meshes;
• ontwikkel je innovatieve pipelines die beeldinformatie, biomechanische modellen en klinische data combineren om het risico op een aortadissectie te voorspellen;
• beoordeel je kritisch de prestaties van de modellen en vertaal je de uitkomsten naar klinisch en biomechanisch relevante inzichten;
• schrijf en publiceer je samen met collega’s artikelen in vooraanstaande wetenschappelijke tijdschriften;
• presenteer je onderzoeksresultaten op wetenschappelijke bijeenkomsten, workshops en internationale congressen.

Je hebt affiniteit met het werken met 3D- of 4D-beeldanalysemethoden. Ervaring met wetenschappelijk programmeren is essentieel (bij voorkeur in Python). Ervaring met neurale netwerken voor beeldanalyse, inclusief geometrische deep learning-benaderingen, is bovendien zeer relevant. Ervaring met cardiovasculaire beeldvorming en numerieke modellering is een pré.

Daarnaast voldoe je aan de volgende eisen:

• PhD in biomedische technologie of een verwant vakgebied;
• goede samenwerkingsvaardigheden: je werkt goed in teamverband;
• uitstekende beheersing van de Engelse taal in woord en geschrift. Let op: alleen Engelstalige sollicitaties worden in behandeling genomen!