Werken bij Amsterdam UMC

PhD Innovatieve toepassingen v machine learning voor antimicrobial stewardship

Zet je Data Science skills in voor de verbetering van diagnostiek en behandeling van infectieziekten!
PhD Innovatieve toepassingen v machine learning voor antimicrobial stewardship
Vragen?
Solliciteer direct
  • Aantal uur: 32 36 uur per week
  • Werklocatie: Beide locaties Amsterdam UMC
  • Contractvorm: bepaalde tijd
  • Salaris: € 2.901 - € 3.677
  • Reageer tot en met: 10 december 2023
Solliciteer direct Reageer binnen 8 dag(en)
Wat ga je onderzoeken?

Het Antimicrobial Stewardship Team (‘het A-team’), geeft vorm aan het antibioticabeleid in het Amsterdam UMC, en onderzoekt strategieën om het onnodig gebruik van antibiotica te beperken. Behandelaars en onderzoekers werken hier in multidisciplinair verband voortdurend samen om resistentievorming en andere ongewenste bijwerkingen te voorkomen.

Voor stewardship programma’s is het essentieel dat er informatie is over bijvoorbeeld gebruik van antibiotica, soorten infecties, bacteriële resistentie, en therapieduur. Het verkrijgen van betrouwbare en bruikbare informatie kan echter tijdrovend en arbeidsintensief zijn. Nieuwe data-gedreven tools, gebruik makend van machine learning en AI-technieken maken echter steeds meer mogelijk.

Het A-team van het Amsterdam UMC heeft de beschikking over een datawarehouse waarin ziekenhuis breed alle gegevens die relevant zijn voor diagnostiek en behandeling van infectieziekten zijn verzameld en geïntegreerd. Hiermee zijn een aantal innovatieve applicaties ontwikkeld die gebruikt kunnen worden voor semi-automatische surveillances. Doorontwikkeling van dit soort tools zullen stewardship-interventies aanzienlijk vereenvoudigen. Op termijn zullen ze zelfs rechtstreeks ingezet kunnen worden in de klinische zorg, om personalised medicine mogelijk te gaan maken.

Vragen over deze functie?
Tanja Hart Tanja Hart +31621603178 Recruitment adviseur
Wat ga je doen?

De focus van dit promotietraject ligt op het ontwikkelen van innovatieve tools die medische informatie uit het EHR beschikbaar maakt voor diagnostische en antimicrobiele stewardship projecten

Beoogde projecten:

  • Onderzoeken wat de beste methode is om diagnoses te extraheren uit het EHR (bv: gebaseerd op huidige diagnose-registratie aangevuld met text-mining-based AI-technieken).
  • Ontwikkeling van een applicatie die relevante informatie van kweken, diagnoses en medicatievoorschriften (semi-)automatisch kan koppelen ('bug-drug combinaties').
  • Ontwikkelen van predictie-model dat real-time de kans op een bacteriemie kan voorspellen in opgenomen patiënten, gebaseerd op routinematig aanwezige informatie in het EHR.
  • Uitbouwen van dit predictie-model naar identificatie van pathogeen-groepen (S.aureus, gram-negatieve staven), gecombineerd met risicogroepen voor cefalosporine-resistentie (oa ESBL).
  • Gebruik van clustering en visualisatie-technieken voor het ontwikkelen van applicaties voor het real-time monitoren van het beloop van infecties en kuurduren.
Wat neem je mee?

Als promovendus die gaat werken in een multi-disciplinair team breng je de volgende kwaliteiten en vereisten met je mee:

  • Je hebt de opleiding medische informatiekunde (bijna) afgerond, of beschikt over een vergelijkbare relevante WO opleiding of achtergrond;
  • Je bent ervaren in het programmeren met Python en/of R;
  • Comfortabel in het werken met databases, SQL;
  • Je beschikt over goede communicatieve en sociale vaardigheden;
  • Je kunt gedisciplineerd werken en beschikt over doorzettingsvermogen;
  • Bewezen ervaring met het schrijven van wetenschappelijke artikelen is een pré, maar geen must.
Wat bieden we jou?
  • Een vliegende start van jouw carrière in het onderzoekswerk.
  • Een uitdagend promotietraject van 4 jaar met zowel klinische als preklinische aspecten.
  • Samenwerking met gemotiveerde collega’s van diverse disciplines, zowel binnen als buiten het Amsterdam UMC.
  • Inschaling in salarisschaal OIO: € 2.901 tot € 3.677 bruto bij een fulltime dienstverband (afhankelijk van opleiding en ervaring).
  • Je start met een jaarcontract (12 maanden) met de intentie tot verlenging met nog eens 3 jaar (36 maanden).
  • Naast een goed basissalaris krijg je onder andere 8,3% eindejaarsuitkering en 8% vakantietoeslag. Bereken hier jouw netto salaris.
  • Pensioenopbouw bij BeFrank, een modern, begrijpelijk en eerlijk geprijsd pensioen.
  • Uitstekende bereikbaarheid met het OV en vergoeding van een groot deel van je reiskosten. Daarnaast hebben we voldoende parkeerplaatsen op locatie AMC én een goede fietsregeling.
Bekijk alle arbeidsvoorwaarden bij AMR
Waar ga je werken?
  • Je gaat werken bij het A-team; het samenwerkingsverband van de afdelingen Medische Microbiologie en infectiepreventie met de afdelingen Infectieziekten en de Apotheek. In aanvulling op je onderzoekstaken verzorg je enkele taken van dit team, zoals het organiseren en analyseren van het periodieke scoren van antibiotica-voorschriften.
  • Naast het A-team neem je ook deel aan het data-team dat het datawarehouse beheert.

In deze teams werken enthousiaste mensen, die in goede sfeer samenwerken, geinteresseerd zijn in infectieziekten, en passie hebben voor data-gedreven patientenzorg. Er zijn collega-datascientists en PhD-students werkzaam binnen deze teams.

Het A-team verzorgt ook een regionaal project in samenwerking met het ABR-zorgnetwerk, en een landelijke registratie (‘de Antimicrobial Stewardship Monitor’), waaraan je zal deelnemen.

De cultuur is open en de samenwerking over het algemeen laagdrempelig. Bovendien streven we naar gelijke kansen voor iedereen. Dat betekent dat er ruimte is voor een ieders cultuur, afkomst, ideeën en creativiteit. Bekijk onze aanpak omtrent diversiteit en inclusie.
Wat kun je verwachten?
Een baan in onze prachtige hoofdstad
Werken bij dé favoriete werkgever in de zorg (intermediair 2021)
Alle collega's hebben hetzelfde doel: bijdragen aan de zorg voor morgen
Er is ruimte voor ontplooiing, verdieping en verbreding van je kennis
Een actieve personeelsvereniging die leuke activiteiten organiseert en korting op producten en diensten voor jou regelt
Amsterdam UMC innoveert continu, dat vraagt om een flexibele instelling van iedereen
Twee grote locaties, goed voor je stappenteller!
Je hebt meer dan 15000 collega’s die je niet allemaal persoonlijk zult leren kennen
Het verhaal van Amsterdam UMC Bekijk de video’s en leer meer over onze organisatie
Amsterdam UMC
Tulp
Verpleegkundige visie
Laten we kennis maken

Gedurende de publicatieperiode worden sollicitaties doorlopend behandeld. Bij invulling van de vacature wordt deze voortijdig gesloten.

Heb je nog vragen? Voor inhoudelijke informatie kun je terecht bij Rogier Schade via r.schade@amsterdamumc.nl.

Voor meer informatie over de sollicitatieprocedure kun je contact opnemen met Tanja Hart, Recruitment adviseur, via 06-21603178 of via recruitment@amsterdamumc.nl.

Een referentiecheck, screening en aannametest kunnen deel uitmaken van de procedure. Lees hier of dat voor jou van toepassing is. Als je bij ons in dienst komt, vragen we je om een VOG (Verklaring Omtrent Gedrag).

Interne kandidaten krijgen bij gelijke geschiktheid voorrang op externe kandidaten.

Acquisitie naar aanleiding van deze vacature wordt niet op prijs gesteld